基建处是学院基本建设管理工作的职能部门，在分管院长的领导下，负责落实学院规划的基本建设任务的实施与管理。学院建校初期即设立了蚌埠学院（筹）基建办公室，蚌埠学院升本后更名为基建处，2009年7月基建处更名为基建办公室，现又更名为基建处。多年来，基建处为学校的校舍建设和后勤保障作出了积极而应有的贡献。

基建处下设工程管理科、综合管理科和预决算科，现有工作人员7人，其中处长1人，科长3人，科员3人。